忍部屋是學院的大本營，也是你與其他學員交流的活動場所，每個時間段和其他隊員流會有不同的對話。

在忍部屋中有任務、忍道場、更衣室、資料室、購買部、記錄等功能，后面會一一介紹。

在任何時間按手柄的START或RB鍵可切出主菜單，上面有更多的功能選擇，你可用它挑戰任務，連線對戰，更換控制角色、或學園等等。　

在忍部屋中隨時按B鍵可進入學校選擇界面，選擇其它學園進行游戲。